Po uratowaniu życia ich spadkobiercy, wytrwały samotnik Snake Eyes zostaje przyjęty do starożytnego japońskiego klanu zwanego Arashikage, gdzie uczy się sposobów walk ninja. Ale kiedy tajemnice z jego przeszłości zostają ujawnione, honor i lojalność Snake Eyes zostaną przetestowane – nawet jeśli oznacza to utratę zaufania najbliższych.